输卵管性不孕原因包括感染病菌、子宫内膜异位症、人工流产等，其中输卵管性不孕的主要原因是感染了衣原体和淋病奈瑟菌。多种原因导致输卵管性不孕，而输卵管性不孕带来较为明显的后果就是不孕。导致输卵管性不孕原因有以下三点：
（1）衣原体感染：衣原体感染是导致输卵管性不孕的常见因素之一，国外研究发现，输卵管是沙眼衣原体感染的高发部位，病原体可以持续存在于输卵管上，从而导致输卵管损伤甚至闭塞，严重时导致不孕。
（2）淋病奈瑟菌感染：简称淋球菌，能够引起以泌尿生殖系统化脓性感染为主要表现的性传播疾病。淋球菌进入女性生殖道后，很容易引起宫颈管淋菌性炎症，通过进一步的上行，引起输卵管黏膜的上皮细胞损伤、坏死和脱落，从而导致输卵管内瘢痕形成、粘连不通，并导致输卵管伞部与周围粘连、闭锁，影响了精子和卵子的相遇，阻碍受精，导致不孕不育。
（3）结核菌感染：有报道指出，慢性腹痛和既往结核史是输卵管性不孕的危险因素之一，不孕患者中的15%存在生殖器结核，而输卵管结核占其中的85%-95%。结核菌首先是对肌层或黏膜下层进行感染，然后逐渐向黏膜及浆膜层蔓延，使得输卵管逐渐增大、管壁增厚，输卵管的表面出现多数粟粒样结节的病变，并粘连周围，导致发生输卵管粘连。
（4）其他病菌感染：化脓性葡萄球菌、链球菌、大肠杆菌及绿脓杆菌，容易导致发生间质性输卵管炎、峡部结节性输卵管炎、输卵管积水和输卵管积脓等，进一步导致输卵管性不孕。
子宫内膜异位症容易导致盆腔粘连、输卵管阻塞、闭塞或者蠕动减弱，影响了摄取卵子和孕孕育卵子，其中大多数是输卵管的峡部（即输卵管最细的部分）发生闭塞，逐渐形成输卵管性不孕。
人工流产虽然没有直接导致输卵管性不孕，但是人工流产的并发症如盆腔炎等能导致医源性输卵管性不孕发病率的上升。
